Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SH3BP4Q9P0V3 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SH3BP4Q9P0V3 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SH3BP4Q9P0V3 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SH3BP4Q9P0V3 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SH3BP4Q9P0V3 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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