Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms