Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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