Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXQ1Q9C009 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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