Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD40Q6AI12 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms