Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C10orf55Q5SWW7 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms