Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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