Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms