Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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