Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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