Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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