Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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SNTA1Q13424 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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SNTA1Q13424 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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SNTA1Q13424 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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SNTA1Q13424 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNTA1Q13424 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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