Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CHAF1BQ13112 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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