Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms