Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms