Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms