Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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