Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms