Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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COL19A1Q14993 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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COL19A1Q14993 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL19A1Q14993 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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