Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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