Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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