Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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