Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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FOXC1Q12948 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXC1Q12948 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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