Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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