Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LMAN2Q12907 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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