Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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BPTFQ12830 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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