Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms