Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRDP23468 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRDP23468 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRDP23468 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
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