Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTLA4P16410 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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