Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms