Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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