Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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