Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GTF3C6Q969F1 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms