Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms