Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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COL24A1Q17RW2 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL24A1Q17RW2 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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