Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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