Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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