Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms