Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ITGB3BPQ13352 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ITGB3BPQ13352 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ITGB3BPQ13352 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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