Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SP140Q13342 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms