Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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