Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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