Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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