Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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