Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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