Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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