Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TDP1Q9NUW8 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TDP1Q9NUW8 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TDP1Q9NUW8 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TDP1Q9NUW8 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TDP1Q9NUW8 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TDP1Q9NUW8 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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