Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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