Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms