Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHHQ15465 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHHQ15465 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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